Prostat Kanserli Olgularda miRNA İfadelenme Düzeylerinin Karşılaştırmalı Analizi


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, TIBBİ BİYOLOJİ VE GENETİK ANABİLİM DALI, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2021

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Venhar Gürbüz

Danışman: Ece Konaç

Özet:

Epigenomun önemli bir bileşeni olan mikroRNA'lar (miR’ler), sinyal yolağındaki hedef

genlerin transkriptom düzeyinde ifadelenmesini modüle ederek kanser gelişiminde etkin rol

oynarlar. Bu tez çalışmasında ilk olarak prostat kanserinde (PCa) yeni miRNA sınıfı olan epimiRNA'ların

ekspresyon seviyesi klinikopatolojik (Gleason Skoru, PSA seviyeleri, TNM

Evreleme) evrelere göre kantitatif real time PCR metodu ile araştırılmıştır. Daha sonra

ekspresyon seviyeleri önemli ölçüde yüksek bulunan 11 epi-miRNA'nın promoter metilasyon

seviyeleri metilasyon spesifik kantitatif real time PCR metodu ile incelenmiştir. Elde edilen

sonuçlara göre, miRNA'ların promoter bölgelerinde, PSA seviyeleri (miR-34b / c, miR-148a,

miR-152), GS'ler (miR-34a-5p, miR-34b/c, miR-101-2, miR-126, miR-148a, miR- 152, miR-

185-5p) ve T evreleme (miR-34a-5p, miR-34b/c, miR-101-2, miR-126, miR-140, miR-148a,

miR-152, miR-185-5p) ile doğru orantılı artış gösteren hipometilasyon bulunmuştur. miR-

200a/b klinikopatolojik parametrelere göre değerlendirildiğinde, lokal/lokal ileri PCa'da onkomiR,

metastatik aşamada tümör baskılayıcı miR olarak görev yapmaktadır. Bir sonraki

aşamada PCa’da up-regüle olduğunu bulduğumuz miR-34b, miR-34c, miR-148a, miR-152,

miR-200a, miR-200b epi-miRNA’lar (miR-200a ve b metastatik evrede down-regüle olarak

tanımlanmıştır) ile onların hedef genleri olan DNA Metiltransferaz (DNMT1, 3a, 3b), PTEN ve

NKX3.1’in “epi-miRNA-mRNA” düzenleyici ağı araştırılmıştır. Elde edilen sonuçlarda miR-

148a, miR-152 ve miR-200b’nin DNMT1’in ifadelenmesini arttırıp, PTEN genini baskıladığı

gösterilmiştir. PCa’nın metastatik yönetiminde epi-miRNA-mRNA çift yönlü geri beslenme

döngüsüne ve anti-kanser terapötiklerinde metilasyon örüntüsüne dikkat çeken bu tez

çalışması, PCa'da tanısal ve prognostik biyobelirteçler olarak miRNA'ların ve metilasyon

sürecinin ve bu süreçte yer alan genlerin mRNA ve miRNA ifade profillerinin bütünleştirici

analizine de dikkat çekmesi açısından yeni, öncü ve önemli bir tez çalışmasıdır.

Anahtar Kelimeler : Prostat Kanser, Epigenetik, DNMT, PTEN, Epi-miRNA, DNA Metilasyonu