İnsan dişlerinde periapikal hastalıklara sebep olan bazı patojen bakterilerin polimeraz zincir reaksiyonu ve porphromonas gıngıvalıs' in eş zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu ile nicel olarak tespiti


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2012

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: İbrahim Araz

Danışman: LEYLA AÇIK

Özet:

Akut apikal inflamasyon, periapikal dokularda hasara yol açan sınırlandırılmış veya yaygın likefaksiyon şeklinde olabilen lezyonlardır. Her ne kadar oluşan enfeksiyon bakterilere ve pulpada nekroz oluşturan irritan başka maddelere bağlı olabileceği ileri sürülse de mikroorganizmalar dişin pulpası ve periapikal dokuları ile ilgili hastalıklarda en önemli etiyolojik faktörler olarak kabul edilmektedir. Kanal içindeki bakteriler de periapikal lezyona sebep olabilir. Bu nedenle bakteriler kanal içinden ve kök kanal sisteminden uzaklaştırılmalıdır. Bu sayede tedavide başarı sağlanabilir. Kök kanalı içinde inflamasyona (abse) yol açan çok sayıda bakteri bulunmaktadır ve bu karışık flora hem aerobik hem de anaerobik mikroorganizmalardan oluşmaktadır. Son yıllarda kök kanalı enfeksiyonları ve periapikal hastalıkların büyük çoğunluğundan anaerobik bakterilerin sorumlu olduğu rapor edilmektedir. Bu nedenle kanal içindeki aerob veya anaerob tüm mikroorganizmalar, kök kanal sisteminden uzaklaştırılmadığı sürece tedavide başarısızlıklar olabilecektir. Son yıllarda toplumumuzda uygunsuz antibiyotik kullanımı veya çoklu ilaç direncine sahip mikroorganizmaların sayısında artış görülmesi nedeniyle özellikle inatçı ve tekrarlayan enfeksiyonlarda kanal içinde bulunan mikroorganizmaların türlerinin belirlenmesi, tedavi için gerekli antibiyotik seçimine karar verilmesi açısından önem taşımaktadır. Bu nedenle enfekte alanlardan alınan örneklerin kültürünü yapılması gibi klasik, konvansiyonel mikrobiyolojik yöntemler kullanılarak mikroorganizma türünün tespit edilmesi gerekmektedir. Ancak ağız içi bakterilerinin çoğunun geç ve güç üreyen bakteriler olması, bir kısmının anaerob koşullarda inkübasyon sürelerinin uzun olması nedeniyle kültür yöntemi ile tespiti uzun zaman almaktadır. Bununla birlikte karışık floradan tür düzeyinde tanımlanması çok fazla besiyeri ve tanımlama kiti kullanımı gerektirdiği için masraflı ve zor olmakta, ayrıca her mikroorganizma türünün de in vitro kültürünün yapılabilmesi mümkün olamamaktadır. Bu çalışmada kök kanal enfeksiyonlarında en sık görülen bakterilerin tanımlanmasında hızlı, özgül ve güvenilir bir yöntem olarak kabul edilen ve karışık flora içinde bile hızlı tür tayinine imkân sağlayan polimeraz zincir yöntemi (PZR) ve mikroorganizmaların nicel değerlendirilmesinde kullanılan nicel eş zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qPZR) teknikleri uygulanmıştır. Materyal olarak pulpal ve periapikal enfeksiyon hastalıkları olan dişlerin kök kanalından aseptik şartlarda kültür örnekleri Ankara Üniversitesi Diş Hekimliği Fakültesi Endodonti bölümünde alınmıştır. Alınan örneklerin DNA izolasyonları yapılmış ve Porphyromonas gingivalis türü bakteri için tasarlanan 16S rRNA bölgesine özgü primerlerle PZR işlemi yapılmıştır. Daha sonra Porphyromonas gingivalis türü PZR pozitif olarak bulunan örneklerden eş zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (qPZR) lightcyler 480 (Roche, İsviçre) ile nicel analizleri yapılmıştır.