Potansiyel probiyotik adayı Enterococcus faecium bakterilerinin güvenliği


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2020

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: NUR SEDA AHLATCI

Danışman: Zehranur Yüksekdağ

Özet:

Çevresel bir epidemiyolojiye sahip olan Enterococcus faecium suşları, insanlarda nozokomiyal enfeksiyonlarda çok önemli bir problem olarak görülmelerinden dolayı probiyotik olarak önerilebilmeleri için virülans ve direnç genleri içermemeleri gerekmektedir. Tez çalışmasında Türkiye ve İran’ ın farklı bölgelerinde üretilen beyaz peynirlerden izole edilen toplam 20 Enterococcus faecium suşlarının probiyotik olarak kullanılabilme güvenilirliğinin belirlenmesi hedeflenmiştir. Bu amaçla, bakterilerin disk difüzyon yöntemiyle 10 antibiyotiğe duyarlılıkları, jelatinaz ve sitolizin üretim yetenekleri ve biyofilm oluşturma yetenekleri belirlenmiştir. Ayrıca, vankomisin direnç genleri (van A ve van B) ve virülans faktörlere (gelE, cylA, cylB, esp, agg ve asa1, efaAfm, cob, ccf, hyl) ait genler Polimeraz Zincir Reaksiyonu (PZR) ile araştırılmış ve genlerin varlığı sekans analizi ile doğrulanmıştır. Son olarak vankomisin direnç ve virülans genlerin plazmid aracılığı ile aktarılabilme olasılığından dolayı bakterilerin plazmid DNA’ları araştırılmıştır. Bakterilerin disk difüzyon yöntemiyle belirlenen antibiyotik duyarlılıkları sonucunda vankomisin, penisilin-G, ampisilin, kloramfenikol’e %100 duyarlı, gentamisin ve polimiksin B antibiyotiklerine %100 dirençli olduğu tespit edilmiştir. Bunun yanı sıra tetrasiklin’e %95, eritromisin’e %61 duyarlı, ofloksasin’e %81 ve rifampisin’e %52 dirençli olduğu görülmüştür. Fenotipik olarak suşların hiçbirisinde jelatinaz, hemolitik aktiviteye bağlı β hemoliz ve biyofilm yapısı gözlenmemiştir. Bakterilerde direnç genlerini bulundurma oranı van A geninde %5, van B geninde %60 olarak tespit edilmiştir. Virülans genler ise efaAfm %95, cob %85, ccf %45, gelE %40, asa1 %20, esp %20, hyl %10 ve agg %5 olarak belirlenmiştir. Suşların hiçbirisinde cob ve ccf genlerine ve plazmid varlığına rastlanmamıştır. Enterokokların probiyotik olarak önerilebilmeleri için virülans genlere sahip olup olmadığının belirlenmesi gerektiği kanısına varılmıştır.