Interactive Pharmacokinetics: A Software for Discovery, Analysis, and Simulation

Creative Commons License

Güvel M. C., Uluoğlu C.

GAZI MEDICAL JOURNAL, cilt.0, sa.0, 2025 (ESCI, Scopus, TRDizin)

Özet

kaynak kodlu ve Python tabanlı bir yazılım paketi olan “interaktif

farmakokinetiki (FK)” geliştirmeyi amaçladık. Temel hedefimiz,

endüstri standardı FK modelleme araçlarına erişimdeki maliyet ve

karmaşıklık engellerini aşmak; öğrenciler ve araştırmacılar için teorik

FK prensiplerinin pratik uygulamasını kolaylaştırmaktır.

Yöntemler: Yazılım, ilaç konsantrasyon-zaman profillerini simüle etmek

için diferansiyel denklem sistemlerini çözerek bir, iki ve üç kompartmanlı

modelleri kullanmaktadır. Parametre tahmini, logaritmik hata kareleri

toplamını en aza indirmek için doğrusal olmayan optimizasyon

algoritmaları kullanılarak gerçekleştirilir. Platform; temel hesaplamalar

için NumPy ve SciPy kütüphanelerini, popülasyon verilerinin paralel

işlenmesi için ise multiprocessing kütüphanesini kullanarak Python

dilinde geliştirilmiştir.

Bulgular: Kullanıcı dostu bir grafik kullanıcı arayüzüne sahip, tam entegre

ve işlevsel bir yazılım uygulaması oluşturuldu. Platform, kullanıcıların

simülasyonlar yürütmesine ve Cmax ile Tmax gibi temel parametreler

dahil olmak üzere sonuçları görselleştirmesine olanak tanımaktadır.

Yazılım, tek kompartmanlı modeller için hasta verilerinden sıfırdan

parametre tahmini gerçekleştirebilmekte ve önceden sağlanan verileri

kullanarak yeni iki ve üç kompartmanlı modelleri oluşturabilmektedir.

Sonuç: Bu yazılım, temel FK simülasyonu ve modellemesi için erişilebilir

ve ücretsiz bir araç sunmaktadır. Araç, özellikle kaynakların kısıtlı

olduğu ortamlarda, hem farmakoloji eğitimi için değerli bir pedagojik

enstrüman hem de ön araştırmalar için yetenekli bir platform görevi

görmektedir. Gelecekteki çalışmalar, kabul görmüş yazılımlara karşı

kapsamlı bir validasyon gerçekleştirilmesine odaklanmalıdır