Kanserli hücrelerin mikroarray gen ifadelerinin incelenmesi ve veri madenciliği yöntemleri kullanarak sınıflandırılması

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, -, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2012

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: MURAT AKIN

Danışman: HASAN ŞAKİR BİLGE

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Biyoinformatik, bilgisayar bilimleri, matematik ve istatistiğin entegrasyonu sonucundan ortaya çıkan, biyolojik sistem ve olaylar hakkındaki bilgilerin derlenmesi ve değerlendirilmesini amaçlayan disiplinler arası bir bilimdir. Biyoinformatik bilim dalının hedefi biyolojik olaylardan doğan bilgileri elde etmek ve bu bilgilerin saklanması için veritabanları oluşturmak ve bilişim teknolojilerinin yardımıyla biyolojik olayların moleküler düzeyde açıklanmasına olanak sağlamaktır.Veri madenciliği, çok büyük veri tabanlarındaki ya da veri ambarlarındaki veriler arasında bulunan ilişkiler, örüntüler, değişiklikler, sapma ve eğilimler, belirli yapılar gibi ilginç bilgilerin ortaya çıkarılması ve keşfi işlemidir. Daha basit bir tanım yapmak gerekirse, büyük ölçekli veriler arasından ?değerli bilgiyi? elde etmektir. Bu sayede, veriler arasındaki ilişkileri ortaya koymak ve gerektiğinde ileriye yönelik tahminlerde de bulunmak mümkündür. Veri madenciliğinde sınıflandırma yöntemleri ise kurulan modele göre verilerin daha önceden nitelikleri bilinen gruplara dağılımına olanak tanımaktadır.Bu çalışmada, biyoinformatik alanında mikroarray verilerine sınıflandırma yöntemleri uygulanmıştır. Kanserli olma ihtimali olan hücrelerden alınan verilere uygulanan algoritmalar sonucunda, örneklerin doğru bir şekilde sınıflandırılması amaçlanmıştır. Burada farklı kanser çeşitleri için analizler yapılmıştır. Sınıflandırma yöntemleri olarak Destek Vektör Makineleri, Naive Bayes, K-En Yakın Komşuluk ve Doğrusal Ayırma Analizi sınıflandırıcı kullanılmıştır.