Akut myeloid lösemi (AML) ve myelodisplastik neoplazi (MDS) olfularında yeni nesil dizileme (YND-NGS) yöntemi ile genetik değişikliklerin saptanması, dökümlenmesi ve klinik bulguları ile karşılaştırılması

---

Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Cerrahi Tıp Bilimleri, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: BERKAY ŞİMŞEK

Danışman: FERİHA PINAR UYAR GÖÇÜN

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Başta AML olmak üzere myeloid neoplaziler dünyada kansere bağımlı ölümlerin önde gelen sebepleri arasındadır. Geleneksel kemoterapi yaklaşımlarına direnç gösteren, hızlı seyirli ve kötü prognozlu vakalar; bu hastalıkların patogenezinin incelikle irdelenmesini ve sahip oldukları genetik değişikliklere göre hedefe yönelik tedavilerin araştırılmasını gerekli kılmıştır. Yeni nesil dizileme (YND) yöntemleri bu bağlamda elimzideki veriyi hızlı ve verimli şekilde arttırmaktadır. Çalışmamızda, akut myeloid lösemi (AML) ve myelodisplastik neoplazi (MDS) tanısı alan hastaların YND yöntemi ile somatik gen değişikliklerini tanımlamak, bu değişikliklerin hastaların klinik özellikleri ile olan ilişkilerini tespit etmek ve kişiselleştirilmiş tedavileri için yol gösterici olmak amaçlanmıştır. Çalışmamızda 2019-2022 yılları arasında bölümümüzde tanı konulmuş 49 AML ve 24 MDS vakası (toplamda 65 kemik iliği ve 8 periferik kan örneği) QIAGEN GeneReader YND sistemi kullanılarak analiz edildi. AML vakalarında en sık değişiklik saptanan 3 gen FLT3 (%16,3), RUNX1 (%14,2) ve IDH2 (%14,2) idiMDS vakalarında en sık değişiklik saptanan 2 gen SF3B1 (%25) ASXL1 (%12,5) idi. En çok görülen mutasyon tipleri arasında yaş, cinsiyet ya da sağ kalım yönünden istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmadı. Çalışmamızda gösterdiğimiz AML olgularında 12, MDS olgularında 9 adet varyant, literatürde ilk defa raporlanmaktadır. Ancak genel olarak baktığımızda sonuç olarak, myeloid neoplazilerin mutasyon profilininin doğru ve hızlı bir şekilde değerlendirilmesini, düşük düzeylerde bile ortaya çıkan gen değişikliklerininin tespit edilmesini ve akılcı tedavi kararları alınmasını sağlayan YND yöntemi ile çalışmamızda, AML ve MDS olgularının mutasyon profilinin ve klinik verilerle olan ilişkisinin literatürdeki diğer çalışmalar ile çoğunlukla benzer olduğu görüldü