Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Tıbbi Mikrobiyoloji Anabilim Dalı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: KATREN ALBAKKOUR
Danışman: Ayşe Kalkancı
Özet:
Rotavirus, çocuk çağında görülen gastroenteritlerinin sebeplerindendir. Gelişmekte olan
ülkelerde mortalite ve morbiditenin en yaygın nedenlerindendir. Bu çalışmanın amacı,
Ankara'da üçüncü basamak bir hastaneye başvuran, 0-65 yaş arasında, akut gastroenteritli,
rota virüs hızlı antijen testi pozitif hastaların dışkı örneklerinde rotavirüsün genotiplerinin
RT PZR yöntemi ile belirlenmesidir. Bu çalışma Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi
Mikrobiyoloji Anabilim Dalı’na Ocak 2013 ile Nisan 2018 tarihleri arasında gastroenterit
şikayeti ile başvuran ve dışkıları Mikrobiyoloji laboratuvarına yollanan ve
immünokromatografik yöntem ile pozitif bulunan, 0-65 yaş arasındaki 87 (40 kız, 47
erkek) hastanın dışkı örnekleri toplanarak gerçekleştirilmiştir. Rotavirus VP-7
amplifikasyonu Beg9 ve End9 primerleri kullanılarak, G genotiplendirme G1-G4 ve G9
için özgül primerler kullanılarak gerçekleştirilmiştir. VP-4 amplifikasyonu con-2 ve con-3
primerleri kullanılarak yapılmıştır. P genotipleri P[8], P[4], P[6] ve P[9] için özgül
primerler ile belirlenmiştir. VP4 ve VP7 gen amplifikasyonu için AccessQuick RT-PZR
(Promega Corporation, Madison, WI), genotiplendirme için de PZR Mastermix (Promega,
Madison, WI) kullanılmıştır. Rotavirus antijen pozitifliği saptanan olguların cinsiyetler
arasında istatistiksel olarak anlamlı bir fark saptanmamıştır. Rotavirus enfeksiyonu en sık
12-23 aylık çocuklarda saptanmıştır. Antijen pozitifliğinin en sık kış ve sonbahar
mevsiminde yoğunlaştığı izlenmiştir. Tiplendirme sonucunda G1 (% 25,80), G2 (% 3,22),
G3 (% 4,30), G4 (% 6,45), G9 (% 60,21) G tipi olarak belirlenmiştir. P4 (% 1,14), P8 (%
93,10), P6 (% 5,74) P tipi olarak belirlenmiştir. Hem G hem de P tipleri birlikte tespit
edilmiştir. En sık görülen tipi G9P[8] (% 56,98) ve G1P[8] (% 22,58) olduğu saptanmıştır.
Tüm dünyada olduğu gibi bizim çalışmamız’daki Rotavirüs enfeksiyonu olan olgularda da
G9 ve P[8]’in en sık genotipler olduğu görülmüştür. Benzer çalışmalar en sık G9P[8] tespit
edilmiştir. Ancak yıldan yıla G9 genotipinin Ankara ’da arttığı görülmüştür.
Anahtar Kelimeler : Rotavirus, VP4, VP7, VP6, NSP4, RT-PCR.