Çocuk ve adolesan lenfomalarının etyopatogenezinde tümör baskılayıcı genlerde dna metilasyonunun rolü


Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2017

Öğrenci: İHSAN ÖZDEMİR

Danışman: FARUK GÜÇLÜ PINARLI

Özet:

Amaç: Çocukluk çağı lenfomalarının etyopatogenezinde epigenetik değişikliğe uğrayarak rol oynadığı öne sürülen 7 ayrı gen için ekpresyon ve metilasyon durumlarını belirleyerek genel ve olaysız yaşam üzerine olan etkisini araştırmaktır. Hastalar ve Yöntem: Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Çocuk Sağlığı ve Hastalıkları Anabilim Dalı, Çocuk Onkoloji bölümünde 2000-2015 yılları arasında izlenen 41 HL, 15 NHL ve 40 maliyn olmayan lenf nodu proliferasyonu olmak üzere, patolojik değerlendirmesi merkezimizde yapılan ve doku örnekleri yeterli olan toplam 96 çocuk çalışmaya alındı. Doku örneklerinden DNA ve RNA izolasyonu yapılarak RT- qPCR ve metilasyon spesifik PCR çalışması yapıldı. Bulgular: Hasta ve kontrol grupları karşılaştırıldığında hasta grubunda SPI1, PRDX2, KLF4, DLEC1 DAPK1 genlerinin kontrol grubuna göre istatistiksel olarak anlamlı derecede daha az ekprese olduğu, CDKNA2 ve FOXO1 genlerinin ekspresyonunun ise hasta ve kontrol gruplarında istatistiksel olarak farklı olmadığı görüldü. Metilasyon oranlarına bakıldığında; CDKN2A ve FOXO1 geni hariç çalışılan tüm genlerde metilasyon oranları HL ve NHL gruplarında kontrol grubuna göre istatistiksel olarak anlamlı derecede yüksek bulundu. Sonuç: Çocukluk çağı HL ve NHL hastalarının tümör doku örneklerinde SPI1, PRDX2, DLEC1, KLF4, DAPK1 genlerinin hipermetilasyon ile susturuldukları saptandı. CDKN2A geninin hem hasta hem de kontrol gruplarında ekprese olmaması nedeniyle maliyniteye özgül olmadığı sonucuna varıldı. FOXO1 geni ise hem hastalarda hem de kontrol gruplarında ekprese olduğundan maliynite ile ilişkisi gösterilemedi.