Papiller tiroid karsinomlarında braf V600E mutasyonunun realtime PZR analizi


Creative Commons License

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2024

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: SERPİL ÇAKIR

Danışman: Leyla Açık

Özet:

Papiller tiroid karsinomları (PTK) çoğunlukla, genlerdeki BRAF ve RAS mutasyonlarından kaynaklı MAPK aktivasyonuyla hücre bölünmelerinde artışa neden olur. BRAF V600E ‘nin PTK’de kötü prognozla ilişkisi olduğu bilinmektedir. Literatürde, PTK hastalarında BRAF V600E mutasyonuyla ilgili yapılmış az sayıda çalışma bulunmakta ve bu çalışmalardan elde edilen bulgular arasında farklılıklar yer almaktadır. Bu çalışmada PTK’de BRAF V600E mutasyonunun realtime PZR (gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu) tekniği kullanılarak tespiti ve toplumdaki sıklığının ortaya konulması ile bugüne kadar elde edilmiş bulgulara yeni bulgular ekleyerek bu alanda var olan literatüre katkı sağlanması hedeflenmiştir. Bu çalışma klasik varyant, folliküler varyant ya da tall cell (uzun hücre) varyant PTK tanısı almış 100 olgudan alınan formalinle fikse edilmiş ve parafine gömülmüş (FFPE) tiroid dokularıyla yapılmıştır. Tümörlü dokuyu örnekleyen kesitlerden yeteri miktarda DNA içeren örneklerden BRAF V600E mutasyon tespit kiti kullanılarak realtime PZR tekniği ile BRAF V600E mutasyonu varlığı araştırılmıştır. Sonuçta, yedi örnekten analiz için yeterli DNA elde edilememiş, geriye kalan 88 örneğin 30’unun (%34,1) BRAF V600E negatif, 58’inin (%65,9) pozitif olduğu tespit edilmiştir. Bu mutasyonun pozitifliğinin PTK varyantlarındaki dağılımı, klasik varyantta %90,4, folliküler varyantta % 11,5 ve uzun hücre varyantta % 80,0 olarak bulunmuştur. Örneklerin BRAF V600E pozitifliği ile yaş, tümör kapsül varlığı, lenf nodu metastazı, yumuşak doku invazyonu ve tiroid kapsül invazyonu değişkeni arasında istatistiksel açıdan anlamlı ilişki tespit edilmiştir (p<0,05). Bu verilerden hareketle PTK’li olguların takibinde ve hastalığın tedavisinde kullanılan yöntemi belirlemede daha büyük olgu grupları ile yapılacak çalışmaların ve BRAF’ın diğer mutasyonlarının analizinin de katkı sunacağı düşünülmektedir.