BAZI MANTARLARDA SİDEROFOR VARLIĞININ GÖSTERİLMESİ


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2009

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: AYŞE SEYER

Danışman: AYŞE KALKANCI

Özet:

Bu çalısmada, kültür koleksiyonundan seçilen çesitli Candida ve Aspergillus suslarında çesitli besiyerleri ve moleküler yöntemler aracılığı ile siderofor varlığının arastırılması amaçlanmıstır. Besiyerleri aracılığı ile siderofor varlığının arastırılması asamasında, CASAD besiyeri, CAS/ MEA besiyeri ve O-CAS besiyeri olmak üzere üç besiyeri kullanılmıstır. CAS/ MEA besiyerinde denenen örneklerin hiçbirinde CAS reaksiyonu gözlenmezken, CASAD besiyerinde %33.3 oranında pozitif sonuç elde edilmistir. Bu üç besiyeri arasında O-CAS besiyerinden %75 oranında pozitif sonuç elde edilmis ve diğer besiyerlerine kıyasla daha basit, duyarlı, ekonomik ve basarılı bulunmustur. İkinci asama olan moleküler yöntemlerle siderofor varlığının belirlenmesi asaması, TaqMan® Probe yöntemine kıyasla, ekonomik olusu ve kısa sürede sonuç vermesinden dolayı SYBR Green yöntemi kullanılarak gerçeklestirilmistir. Bu asamaya 14 örnek ( Candida ve Aspergillus) dahil edilmis ve CaSIT1 primerleri (forward ve reverse) kullanılarak siderofor kodlayan genler tanımlanmaya çalısılmıstır. Real-Time PCR- SYBR Green yöntemiyle elde edilen sonuçlar, konvansiyonel yöntemlerle elde edilen sonuçlarla benzer bulunmustur. 14 örneğin 12'sinde (% 85.7) CaSIT1 primeri ile pozitif sonuçlar elde edilmistir. CaSIT1 primerleri (forward ve reverse) kullanıldığı için C. tropicalis ve A. niger kontrol suslar olarak kullanılmıstır. Bu çalısmanın sonucuna göre; belirlenen standart değerler doğrultusunda (St. 1.03 E1< St. 1.14 E1< St. 1.28 E1< St. 1.52 E1< St. 1.85 E1< St. 4.59 E1) bir standart eğri elde edilmis ve bu standart eğri esas alınarak diğer örneklerdeki sidA gen ifadesi miktarı belirlenmistir.