Candida albicans' a ait ALS, HWP ve staphylococcus epidermidis' e ait ICA genlerinin farklı biyomateryallerdeki ekspresyonlarının real time PCR ile kantitatif analizi

---

Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Sağlık Bilimleri Enstitüsü, -, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2008

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: SEZEN BOLAT

Danışman: AYŞE KALKANCI

Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu

Özet:

Çalışmamızda lateks-slikon, polivinil klorid, polivinilprolidon kaplı poliüretan ve poliüretan kateter yüzeyinde oluşturulan in vitro biyofilm modelinde adezyon genlerinin ekspresyonları karşılaştırılmıştır. Karşılaştırılan adezyon genleri sırasıyla Candida albicans 'a ait ALS1 ve HWP1, Staphylococcus epidermidis 'e ait ICA 'dır. Oluşan biyofilm kütlesi kateter yüzeyinden kazınmış ve mRNA 'ları izole edilmiştir. Bu mRNA 'lar cDNA 'ya çevrilmiş ve real time PCR 'da kantitatif analizleri yapılmıştır. Çalışmamızın sonunda slikonize materyalden yapılmış kateter üzerindeki ALS1 ve HWP1 genlerinin kopya sayısı sırasıyla 2,50 x 105 kopya/ml ve 1,30 x 104 kopya/ml, ICA geninin ise 1,80 x 105 kopya/ml olduğu bulunmuştur. Adezyon genleri polivinil klorid kateterde slikonize olanlardan daha çok eksprese edilmiş olarak bulunmuştur. Polivinil klorid kateter üzerindeki ALS1 ve HWP1 genlerinin kopya sayısı sırasıyla 7,56 x 106 kopya/ml ve 6,68 x 105 kopya/ml olarak, ICA geninin ise 4,20 x105 kopya/ml olarak bulunmuştur. Minimum gen ekspresyonu polivinilprolidon kaplı poliüretan ve poliüretan kateterlerdede saptanmıştır. Biyofilm ilişkili genler PVP ve PUC yüzeyinde veya planktonik hücrelerde farklı bulunmamıştır.Bu çalışmada, adezyonla ilişkili genlerin ekspresyonunun materyalin yapısından etkilendiği bulunmuştur. Bu klinik kullanımda, bir materyalin diğerine tercih edilmesiyle sonuçlanabilir.