Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: Tuğberk EROL
Danışman: Duygu Sarıkaya
Özet:
Kolon kanseri dünyada en sık görülen kanser türlerindendir. Kalın bağırsakta bulunan poliplerin kanser hücrelerine dönüşmeden cerrahi müdahale ile kaldırılması gerekmektedir. Günümüzde poliplerin tanısı sırasında uzmanlara yardımcı olmak için derin öğrenme modelleri geliştirilmektedir. Bu çalışmalar polipleri tespit ederek poliplerin sınırlarını belirlemekte ve bu sayede poliplerin tarama sırasında gözden kaçma oranını azaltmaktadır. Ancak bu güncel çalışmalar çok fazla parametre gerektirmektedir. Çalışmamızda literatüre göre daha az parametre gerektiren bir polip bölütleme modeli önerilmiştir. Modelimiz modifiye edilmiş kısmi kod çözücü ve yardımcı bir kod çözücü ile tutarlılık eğitimi olmak üzere iki temel yenilik önermektedir. Modifiye edilmiş kısmi kod çözücü ile düşük seviye bilgileri içeren kodlayıcı katmanlar kod çözücüde kullanılmayıp orta ve yüksek seviye bilgiler içeren kodlayıcı katmanlar farklı ölçeklerde birleştirilmiştir. Bu sayede düşük seviye bilgilerin tekrarı azaltılmış ancak yüksek seviye bilgiler farklı ölçeklerde birleştirilerek daha fazla anlamsal detayın yakalanması sağlanmıştır. Bunun yanında asimetrik sıkıştır ve genişlet bloğu ile değişken en ve boy oranına sahip lezyon bölgelerindeki detaylar yakalanmıştır. Tutarlılık kaybı ile iki farklı kod çözücünün kayıp değeri hesaplanarak toplam kayba eklenmiş ve bu sayede modelin daha güçlü temsiller öğrenmesi ve lezyon bölgesine odaklanması sağlanmıştır. Çalışmamız kolonoskopi ve kapsül endoskopi görüntüleri içeren beş farklı polip veri kümesinde test edilmiştir. Bu testlerde çalışmamız diğer modellere göre çok daha az parametre gerektirmesine rağmen daha üstün sonuçlar elde etmiştir. Aynı zamanda modelimizin genellenebilirliği hücre çekirdeği görüntüleri ve cerrahi aletler içeren veri kümelerinde de test edilmiş ve bu testlerde de modelimiz üstün sonuçlar elde etmiştir.
Anahtar Kelimeler : Polip Bölütleme, Tutarlılık Eğitimi, Modifiye Edilmiş Kısmi Kod Çözücü, Tıbbi Görüntü Bölütleme, Evrişimsel Ağlar |