Bir seri yeni floren/florenon temelli bileşiklerin sentezi, karakterizasyonu, farklı DNA, RNA ve sentetik oligonükleotidlerle etkileşimlerinin spektroskopik yöntemlerle incelenmesi


Tezin Türü: Doktora

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2016

Öğrenci: ERGİN YALÇIN

Danışman: ZEYNEL SEFEROĞLU

Özet:

DNA ve RNA'yı görüntüleme ve tanımlama çalışmaları amacıyla geliştirilen etkin küçük moleküller, antikanser ajanı olma potansiyelinden dolayı milyonlarca insanı etkileyebilecek olmaları nedeniyle tıpta önemli bir araştırma alanını oluşturmaktadır. Küçük moleküllerin bağlanmasıyla DNA ve RNA'nın yapısında meydana gelen fizyolojik değişimler, biyokimyasal, biyolojik ve tıbbi süreçlerin anlaşılması için önemli bir araçtır. Antikanser tedavisinde DNA, ilaçlar için önemli bir hedef molekülüdür. Bu yüzden DNA'nın çift sarmal veya telomerik DNA yapısının hedeflenmesi vücutta kanser hücrelerinin bölünmesini kontrol eden veya durduran önemli bir süreç olabilir. Öte yandan RNA-küçük molekül etkileşimleri alanındaki çalışmalar, DNA-küçük molekül alanındaki çalışmalardan daha az olmasına rağmen RNA'nın birçok hastalıkta ve genetik süreçlerde yer almasından dolayı popüler hale gelmektedir. Bu çalışmada bir seri yeni floren/florenon temelli birden fazla fonksiyonel grup içeren bileşiklerin sentezi ve karakterizasyonu yapılmıştır. Sentezlenen altı katyonik bileşiğin çift iplikçikli (ds)DNA, dsRNA, p(dA-dT)2 , p(dG-dC)2 ve telomerik DNA oluşturan floresans yapıcı ile etiketlenmis F21T, 22AG oligonükleotidleriyle etkileşimi, moleküler biyolojide floresans işaretleyici olarak kullanılma potansiyelinden dolayı incelenmiştir. Bileşiklerin biyomoleküllerle kovalent olmayan etkileşim çalışmaları için floresans spektroskopisi, UV-GB spektroskopisi, CD spektroskopisi kullanılmış olup termal bozunma ve guanince zengin dizilimler için de FRET deneyleri yapılmıştır. Bileşiklerin DNA/polinükleotitlerle etkileşim çalışmaları sonuçlarından yararlanılarak bağlanma sabiti, seçiciciliği, bağlanma türü ve bağlanma ilgisi belirlenmeye çalışılmıştır