KLİNİK KLEBSIELLA PNEUMONIAE İZOLATLARINDA FENOTİPİK VE GENOTİPİK YÖNTEMLERLE KARBAPENEMAZ ARAŞTIRILMASI
Tezin Türü: Tıpta Uzmanlık
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Gazi Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2022
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: FATMA NUR YİĞİTOĞLU
Danışman: Ayşe Meltem Yalınay
Açık Arşiv Koleksiyonu: AVESİS Açık Erişim Koleksiyonu
Özet:Karbapenemazları eksprese eden Enterobacterales'in dünya çapında yayılması, halk sağlığı açısından önemli bir risk taşımaktadır. Karbapenemazlar küresel dağılım göstermektedir. Kıtasal, ulusal, bölgesel ve hatta merkezden merkeze görülme sıklığında önemli değişiklikler gözlenmektedir. Karbapenemazların saptanmasına yönelik birçok fenotipik ve genotipik test bulunmaktadır. Bu çalışmanın amacı, Klebsiella pneumoniae suşlarındaki karbapenem direncinin fenotipik ve genotipik yöntemlerle duyarlılığının karşılaştırılmasının yanı sıra lokal, ulusal ve uluslararası karbapenemaz epidemiyolojik verilerine katkıda bulunmaktır. Çalışmamıza Ocak 2020- Mart 2021 tarihleri arasında, Gazi Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gönderilen çeşitli klinik örneklerden izole edilen, 76 hastaya ait olan 95 adet Klebsiella pneumoniae izolatı dahil edilmiştir. Karbapenemaz tarama kriterlerine uyan tüm izolatlara, karbapenemaz varlığını fenotipik olarak göstermek amacıyla, karbapenem inaktivasyon yöntemi ve Modifiye Hodge testi uygulanmıştır. Çalışmamızda Modifiye Hodge testinin duyarlılığı %94, karbapenem inaktivasyon yönteminin duyarlılığının %91 olduğu görülmüştür. Genotipik test olan PCR sonuçları değerlendirildiğinde, izolatların %69.2'sinde tek başına OXA-48, %16.7'sinde OXA-48+NDM birlikteliği, %2.6'sında OXA-48+VIM birlikteliği, %1.3'ünde OXA-48+KPC birlikteliği, %5.1'inde tek başına KPC, %3.8'inde KPC+VIM birlikteliği görülmüştür. 1 izolatta OXA-48+KPC+VIM olmak üzere üç gen bölgesi görülmüştür. Genotipik değerlendirmede kullanılan PCR moleküler analiz yönteminin duyarlılığının %100 olduğu gösterilmiştir. Karbapenem inaktivasyon yöntemi ve Modifiye Hodge testinin duyarlılıklarının çalışmamızda yüksek çıkması ve PCR testi ile karşılaştırıldıklarında uygulanabilirliklerinin fazla olması nedeniyle rutin laboratuvarlarda daha rahat kullanılabilir. Ancak moleküler testlerdeki duyarlılığın tam olması sebebiyle genotipik yöntemlerle doğrulama direnç sürveyans çalışmaları açısından önem taşımaktadır. Anahtar Kelimeler: Karbapenemaz üreten Klebsiella pneumoniae, Modifiye Hodge testi, Karbapenem inaktivasyon yöntemi